Проблемы таксономической идентификации уникальных объектов животного происхождения по маркерам митохондриальной ДНК для целей судебной экспертизы

   Прямая идентификация в судебной молекулярно-генетической экспертизе представляет собой непосредственное сравнение идентифицирующих характеристик, таких как профили ДНК объекта идентификации, с идентифицирующими характеристиками объектов сравнения, в том числе полученными из базы данных. При этом идентификация объектов животного происхождения осуществляется в результате сравнения нуклеотидной последовательности целевого участка ДНК, полученной в процессе секвенирования, с различными нуклеотидными последовательностями ДНК, которые хранятся в международных базах данных.

   Целью данной работы было установление видовой принадлежности образца животного происхождения – лакомства для домашних животных «Сублимированная акула».

   Несмотря на то, что это исследование проводилось вне рамок судебной молекулярно-генетической экспертизы, его результаты представляют собой иллюстрацию возможных методических проблем, связанных с установлением таксономической принадлежности редко встречающихся объектов животного происхождения молекулярно-генетическими методами. Авторами статьи показано, что исследование неизвестных объектов животного происхождения методами ДНК-анализа при проведении судебной экспертизы в некоторых случаях будет требовать разработки и применения уникальных частных экспертных методик, а также продемонстрирована целесообразность создания в России единой национальной базы генетической информации с особыми требованиями контроля.

1. Serite C.P., Ntshudisane O.K., Swart E. et al. Limitations of DNA Barcoding in Determining the Origin of Smuggled Seahorses and Pipefishes // Forensic Science International: Animals and Environments. 2021. Vol. 1. 100006. doi: 10.1101/2020.12.09.417998

2. Шеховцов С.В., Шеховцова И.Н., Пельтек С.Е. ДНК-штрихкодирование: методы и подходы // Успехи современной биологии. 2019. Т. 139. № 3. C. 211–220. doi: 10.1134/S0042132419030074

3. Hebert P.D.N., Cywinska A., Ball Sh.L. et al. Biological Identifications through DNA Barcodes // Proceedings of the Royal Society B. 2003. Vol. 270. No. 1512. P. 313–321. doi: 10.1098/rspb.2002.2218

4. Колесников А.А., Герасимов Е.С. Множественность вариантов организации митохондриального генома // Успехи биологической химии. 2012. Т. 52. С. 37–62.

5. Культин А.Ю., Стороженко И.В., Пименов М.Г. и др. Криминалистическое исследование митохондриальной ДНК биологических следов человека. Методические рекомендации. М.: ЭКЦ МВД России, 2008. 80 с.

6. Шнеер В.С. ДНК-штрихкодирование видов животных и растений – способ их молекулярной идентификации и изучения биоразнообразия // Журнал общей биологии. 2009. Т. 70. № 4. C. 296–315.

7. Kress W., Erickson D. DNA Barcodes. Methods and Protocols. Vol. 858. Washington, DC: Humana Press: Totowa, 2012. doi: 10.1007/978-1-61779-591-6_1

8. Rodrigues C.R., de Carvalho D.E.V., Garcia Y. et al. DNA Barcode as an Effective Tool in the Identification of Billfishes (Scombroidei, Teleostei) from Exported Specimens // Forensic Science International: Animals and Environments. 2021. Vol. 1. P. 100028. doi: 10.1016/j.fsiae.2021.100028

9. Основы судебной экспертологии : учебно-методическое пособие. М.: ФБУ РФЦСЭ при Минюсте России, 2023. 383 с.

10. Lijtmaer D.A., Kerr K.C.R., Stoeckle M.Y. et al. DNA Barcoding Birds: from Field Collection to Data Analysis. In: Kress W., Erickson D. (ed.). DNA Barcodes. Washington, DC: Humana Press, Totowa, 2012. Vol. 858. P. 127–152.

11. Staats M., Arulandhu A.J., Gravendeel B. et al. Advances in DNA Metabarcoding for Food and Wildlife Forensic Species Identification // Anal Bioanal Chem. 2016. Vol. 408. No. 17. P. 4615–4630. doi: 10.1007/s00216-016-9595-8

12. Straube N., White W., Ho C.-H. et al. A DNA Sequence-Based Identification Checklist for Taiwanese Chondrichthyans // Zootaxa. 2013. Vol. 3752. No. 1. P. 256–278. doi: 10.11646/zootaxa.3752.1.16

13. Nittinger F., Haring E., Pinsker W. et al. Out of Africa? Phylogenetic relationships between Falco Biarmicus and the Other Hierofalcons (Aves: Falconidae) // Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research. 2005. Vol. 43. No. 4. P. 321–331. doi: 10.1111/j.1439-0469.2005.00326.x

14. Nittinger F., Gamauf A., Pinsker W. et al. Phylogeography and Population Structure of the Saker Falcon (Falco Cherrug) and the Influence of Hybridization: Mitochondrial and Microsatellite Data // Molecular Ecology. 2007. No. 7. P. 1497–1517. doi: 10.1111/j.1365-294X.2007.03245.x

15. Sloan D.B., Havird J.C., Sharbrough J. The On-Again, Off-Again Relationship between Mitochondrial Genomes and Species Boundaries // Molecular Ecology. 2017. Vol. 26. No. 8. P. 2212–2236. doi: 10.1111/mec.13959

16. White W.T., Last P.R., Naylor G.J.P. Scoliodon Macrorhynchos (Bleeker, 1852), a Second Species of Spadenose Shark from the Western Pacific (Carcharhiniformes: Carcharhinidae) // Descriptions of New Sharks and Rays from Borneo. CSIRO Marine and Atmospheric Research Paper. 2010. Vol. 32. P. 61–76.